هنگامی که پلیمر آنتی ژن O به هسته لیپید A متصل شود، واکنش پلیمریزاسیون را متوقف می کند. یعنی واکنش اتصال می تواند واکنش پلیمریزاسیون را خاتمه دهد. هم هسته لیپید A و هم لیپوپلی ساکارید با واحدهای تکرار طول متفاوت می توانند به طور موثری به غشای خارجی منتقل شوند. بنابراین، اندازه مولکولی لیپوپلی ساکارید را می توان با SDS-PAGE مشاهده کرد، که ناشی از تفاوت در سیستم بیوسنتز است تا عامل سیستم خروجی.

توزیع زنجیره جانبی آنتی ژن O در باکتری های مختلف متفاوت است، برخی از آنها حاوی حدود 20 واحد تکرار و برخی از آنها ممکن است حدود 100 واحد تکرار شوند. در الکتروفورز SDS-PAGE، تفاوت در شدت رنگ‌آمیزی نقره مولکول‌های مختلف گونه‌های مختلف باکتری منعکس می‌شود. دلیل توزیع متفاوت طول زنجیره جانبی آنتی ژن O در باکتری های مختلف ممکن است این باشد که یک فاکتور انتخاب اندازه در فرآیند پلی تراکم آنتی ژن O یا واکنش اتصال وجود دارد. Wzz (به عنوان مثال Rol یا Cld) پروتئین مهمی است که توزیع طول زنجیره جانبی را در باکتری‌هایی که آنتی‌ژن‌ها را از طریق مسیر وابسته به Wzy سنتز می‌کنند، تنظیم می‌کند، اما مکانیسم خاص آن هنوز مشخص نیست.